Después de un año tras el Sly 2: Ladrones de Guante Blanco, Sly Cooper y Bentley
intentaron abrir la cámara acorazada de Cooper en la isla Kaine, con la
ayuda de personas misteriosas. Desafortunadamente, son interceptados
por el Dr. M, el propietario de la isla. Sly y Bentley escapan, pero un
monstruo agarra a Sly. Durante esta escena, Sly ve pasar su vida ante
sus ojos, y el juego se mueve hacia atrás en el pasado. Se explica que
Sly había venido a aprender de la cámara acorazada de Cooper está
escondida en la isla de Kaine por uno de los colegas de su padre. La
cámara contiene la riqueza acumulada por el Clan Cooper durante miles de
años. Sly fue a buscar a la cámara, sólo para descubrir que M había
construido una fortaleza en la isla, en un intento de llegar a la
riqueza escondida en la caja fuerte. Sly se dio cuenta de que necesitaba
una banda de ladrones de maestros con el fin de conseguir más allá de
la seguridad extensa de M, y necesitaba a la banda Cooper en acción.
Primero, Sly y Bentley deciden encontrar primeramente a Murray, quien dejó el equipo debido a la lesión de pierna de Bentley, pero espió a un gran jefe, Octavio quien huye a Venecia, Italia, donde Murray estuvo espiándole sigilosamente. Sly se pone al día con Dimitri
otra vez, quien está en prisión, mientras buscando a Murray, que se
compromete a encontrar a Murray si distrae Sly al jefe de la policía Carmelita Fox
y roba las llaves de la celda. Después de ser perseguido por Venecia
por Carmelita, se encuentra de nuevo Murray, quien lo ayuda a escapar.
Él le dice a Sly se ha trasladado a ser un aprendiz de una figura amante
de la paz conocida como el Guru
para ser más pacífico. Murray se niega a unirse a la banda hasta que se
cumpla la tarea que el Gurú le dio a él, esperar a que los canales
estén limpios, lo que obligó Sly y Bentley a derrotar a Octavio que ha
estado contaminando los canales de alquitrán, como parte de un plan para
amenazar a la ciudad, por los edificios se hunden. Después de reunir
algunos planes, destruyen el recital de Octavio, pero hiere a Bentley.
Murray renuncia a su formación y batallas con Octavio, derrotándolo.
Octavio es arrestado, y Murray vuelve a unirse al equipo.
Después de que Murray fallara al Gurú, la banda vuela a Yuendumu, Territorio del Norte, Australia,
para encontrar al Guru, pero la construcción de los mineros se hizo
cargo de la tierra. Después de encontrarlo, lo encerró, y Sly descubre
que el Guru se niega a salir de su celda hasta que tuviera su piedra de
luna y el personal. Después de que Sly los encontrase, Bentley les
devuelve al Gurú y él estalla, tirando de las tareas y el acuerdo para
unirse al equipo si Sly y la ayuda de la pandilla le ayuda a borrar a
los mineros de su tierra. Para ello, tienen que destruir la máscara de
la Tierra Oscura, una máscara de maldad demoníaca que sigue a las caras
de la gente y hace que su portador tenga gran control y los hace más
poderosos. Después de que Carmelita Fox vaya tras Sly, la máscara de la
Tierra Oscura se queda atascada en la cara, y ella empieza a crecer a un
ritmo incontrolable. Sly tiene que subir sus bootlegs y romperla.
Después de que sea destruida por los mercenarios de Carmelita, el Gurú
se une a la banda de Cooper.
En la necesidad desesperada de un experto en combate RC, Bentley se encuentra con un ratón holandés llamado Penelope online, quien está de acuerdo a unirse al equipo si ellos acaban con su jefe Black Baron,
un viajero experto que tiene su propia competición de vuelon (ACES
Flying Competition) y siempre había ganado. La banda viaja a Kinderdijk, Holanda, Países Bajos,
donde apuntan a Sly en a competición de vuelo. Una vez allí, se reúnen
con Dimitri, que se compromete a decirles dónde encontrar la lista de la
competencia, pero sólo si está de acuerdo en que Sly le devuelva el
favor. Cuando Muggshot, antiguo enemigo de Sly en Sly Raccoon,
está volando en la competición, y a Bentley se le ocurre un plan y lo
llevó a la cárcel. Después de que más planes es iniciasen, Sly bate al
Barón Negro, quien conduce contra él luchando contra Sly en el ala de un
avión. Cuando es golpeado, se revela como Penélope, y Sly gana la
competencia. Penélope le dice a la tripulación que había una razón de
ser el barón porque ella era demasiado joven para entrar en la
competencia. Penélope se une a la banda sin dudarlo.
Cuando necesitan a un experto en demolición más allá de Bentley, se dan cuenta de que deben contratar a un viejo enemigo de Sly, el Rey Panda,
de Sly Raccoon. Después de encontrarlo y saber que dejó su vida de
crimen, lo confrontan y él está de acuerdo en participar, pero sólo si
ellos le ayudan a rescatar a su hija, Jing King, de la maldad General Tsao,
quien la raptó y la forzó a casarse con él. Durante este tiempo, Murray
localiza y recupera la furgoneta del equipo, que se encontraba en las
inmediaciones, ayudados por primera vez por Penélope y luego por el Rey
Panda, que reconoce las acciones de los bonos de Murray con la
furgoneta, que es el mismo que comparte con su hija. Sly debe derrotar a
Tsao y volver con con el portátil de Bentley, que fue robado por Tsao.
Finalmente, después de rescatar a Jing King, Tsao es arrestado por
Carmelita, quien lo acompaña a la cárcel y el Rey Panda se une a la
pandilla.
Más tarde, Dimitri mandó un e-mail a Sly y le recuerda el favor que
le debía, por lo que Dimitri compra boletos en un crucero a Blood Bath
Bay, el Mar Caribe. Después de enterarse de que su abuelo, Reme
Lousteau, tenía su equipo de buceo y tesoros que había reunido al robar
por Punto Negro Pete, en su intento de recuperarlo, pero encontró el
mapa al haber sido robado por Capitán LeFwee,
otro pirata peligroso que se conoce como el hombre más inteligente en
los siete mares. Tras sacarle algunos puestos de trabajo, navegan en
busca del tesoro de Reme Lousteau, sólo cuando se encuentran con Sly, se
enfrentan con LeFwee, que secuestra a Penélope y le roba el tesoro. Sin
embargo Dimitri mantiene su equipo de buceo. Después de preparar para
llevarlo adelante, se enfrentan a LeFwee, y Bentley acabó con burlarlo.
Durante la escapada, Bentley está lesionado, y Penélope batallea con
LeFwee y lo deja en el puerto, donde es comido por los tiburones. Por lo
tanto, Dimitri se une al equipo como su hombre rana, y Bentley y
Penélope se convierten en pareja.
El juego vuelve a la actualidad, donde Sly está luchando con M.
Cuando está a punto de ser comido, Sly se da cuenta de que ha sido
"cobarde" hacia Carmelita, lamentando no decirle lo que realmente siente
acerca de ella. Después de ver a Bentley y Penélope juntos, él ahora se
da cuenta de lo que es la vida. Justo en ese momento, Carmelita llega
en vigor en la isla, con la intención de captar tanto a Sly como a Dr M,
derrotando a su monstruo y permitiendo a Sly escapar. Ella termina
luchando contra ella en el mar. Después de la batalla, la banda recupera
a Sly, que es la clave de la cámara acorazada. Durante estos eventos,
nos enteramos de que M aparentemente no fue tratado como un igual por el
padre de Sly, y que él cree que Sly es el mismo.
Después de luchar contra la seguridad, entran en la cámara, donde Sly
ve la historia de sus antepasados. Mientras tanto, M y Sly pelean en la
cámara. Después de que Sly saliera victorioso, M una vez más lo compara
con su padre, pero Sly insiste en que cada uno es un individuo, y que
no es más que él mismo. Carmelita llega a arrestar a los dos, sin
embargo el Dr. M dispara una ráfaga hacia ella, y Sly saltó delante de
ella para evitar su muerte. Carmelita derrota a M y comprueba a Sly.
Parece que sufre de amnesia, en la que pretende que Carmelita y Sly son
pareja. Juntos escapan, y M pierde la vida cuando la cámara entera se
vuelve inestable y colapsa. El resto de la banda de Cooper encuentra a
Sly y a su carta de presentación junto a una abertura alternativa a la
cámara que contiene toda la riqueza del clan Cooper. Al ver que Sly
nunca regresa, la banda se separa, a excepción de Bentley y Penélope,
que están en una relación.
Dimitri se convierte en un buzo rico, el Rey Panda regresa a China,
empieza a vivir a dos puertas del Rey Jing, y pantallas de todos sus
futuros maridos (hasta el momento, todavía es soltero), Murray se fue a
completar su formación con el Guru, después se convirtió en un piloto de
carreras profesional con la furgoneta, y Guru después de terminar la
formación Murray, enseña su arte místico a un grupo de estrellas de rock
(que lo encontró incluso en Nueva York), y Penélope y Bentley han
creado una nueva cámara que contiene la riqueza de Cooper que se
encuentra bloqueada por láser y construyó una máquina del tiempo. Al
final, Sly pide la mano de Carmelita en un balcón, cuando los ve
Bentley. Sly mira directamente a Bentley y le guiña. Esto parece
demostrar que Sly fingió su amnesia. A medida que el juego termina,
Bentley dice "Ese
Hay nuevas variaciones en el juego que incluyen otros personajes
jugables, además de las de Murray, Sly y Bentley. En primer lugar,
Carmelita Fox es un personaje jugable en algunos de los minijuegos y
también un par de veces en el juego. En segundo lugar, algunos nuevos
personajes se han introducido, incluyendo un chamán llamado The Guru y
un ratón llamado Penélope. Por último, los personajes antes mencionados,
tales como Dimitri de Sly 2: Ladrones de guante blanco y el Rey Panda
de Sly Rccoon se pueden jugar también. También Bentley y Murray puede
escoger su propio bolsillo en este juego.
El juego también contiene secciones en 3-D. Las gafas 3-D se han
distribuido con cada copia del juego, y se utilizan en ciertas partes
del juego. Sin embargo, el 3-D es opcional en estas secciones, que
permite al jugador ver los niveles estándar en 2-D. Algunos niveles son
jugables en 3-D desde el principio, mientras que otros requieren niveles
en función 3-D, otra característica de ser objetos en los niveles sólo
son visibles cuando se está reproduciendo en 3-D. El efecto 3-D se
centra en ciertos objetos en el fondo, más que los propios personajes,
minimizando la necesaria separación azul/rojo, y lo que es más fácil ver
a alguien jugando en 3-D sin un conjunto de gafas 3-D.
Además, para aumentar el valor de reproducción, un modo multijugador
en línea se incluye, junto con los desafíos y las películas extras
desbloqueadas con determinados porcentajes de finalización del juego.
Los juegos multijugador son: "Policías y ladrones", "Bi-Plane Duel",
"hackathon" y "Duel Galeón". Los retos son misiones que establecen las
normas específicas, junto con una misión de búsqueda del tesoro para
cada mundo alcanzado al final del juego. Murray y Bentley pueden ahora
ser carteristas. Murray iza guardias aturdidos o desprevenidos por
encima de su cabeza y los sacude para sacarles las monedas y el botín.
Las monedas deben ser recogidas del suelo después de que la guarda se
agitase. Bentley utiliza una caña de pescar como imán para pescar
monedas y el botín. Cuando el imán se une Bentley se aleja de la guardia
con el carrete lleno de marcancías.
Botín ya no tiene que ser vendido de nuevo en la casa de seguridad.
La cantidad de un artículo se agrega inmediatamente al recuento de
monedas. El tesoro especial está ausente de todo el mundo. Sly 3 también
cuenta con nuevos elementos de juego y habilidades, tales como seguros
de craqueo, en busca de pistas y objetos en la pintura, combate aéreo,
disfraces, batallas barco pirata, y las conversaciones. Una
característica que recibieron retroalimentación negativa de los
jugadores es que ya no se puede buscar botellas de pista para abrir una
caja fuerte especial en algún lugar dentro de los diferentes mundos, que
era una parte popular de los dos primeros juegos y el valor añadido de
repetición extra para el juego.
